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在高效液相色谱分析中，人们对色谱柱温度的要求越来越高，药典标准及诸多新的国标行标中的分析方法中，也提出了分析的柱温条件。由于色谱柱恒温箱可以精确、稳定的控制色谱柱的使用温度，在提高色谱柱的柱效，改善色谱峰的分离度，缩短保留时间，降低柱压，保证分析样品结果的重复性和准确性上，具有不可忽视的作用，因而使其成为高效液相色谱仪的重要配套装置。国产柱温箱与进口柱温箱在温度控制精度上都能达 0.1℃，但在温度准确性上还是有一定距离，特别是温度大于45度时，用标准水银温度计测量会发现这个问题。国内某著名大学教授曾发现同样55℃的柱温，使用国产与进口的柱温箱在液谱上的保留时间与分离度存在明显的差别，影响了其学术研究。