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原理特征是利用微波透射、衍射、干涉、偏振以及伴随着电磁波能量传输产生的波动，使蛋白质及核酸等产生变异，使水分子松弛改变排列重新组合。干扰细菌正常的代谢功能，破坏细菌生成条件和延缓遗传繁殖速度从而达到杀菌目的。一般在60-85℃杀死一般菌落及大肠菌。在98℃用微波透射2min可杀死芽孢菌。微波杀菌主要特点是：1.微波杀菌彻底，比其它设备杀菌节约时间50%，比其它电设备节省电40%。比钴60降低成本20倍以上。符合国家环保要求。2.微波设备体积小占地面积少，杀菌速度快，维修操作方便，是当前最为理想的杀菌设备。3.微波杀菌主要对象：中西药剂、牛奶、果蔬饮料、花饮料、茶饮料、蛋白饮料、保健饮料、保健酒、黄酒、葡萄酒、香醋、酱油、糟卤品、豆浆、营养液、调味汁。白酒催熟酿化、化工合成。