在食醋生产中，将红曲与黄曲按一定量混合作为糖化曲，用于食醋生产的第一阶段-糖化，然后再进行酒精、醋酸发酵可酿制成色泽淡红、风味独特的“红寿醋”。

在酱油生产中，如“鹤龟”牌酱油，是将红曲添加到酱曲中一起进行发酵，红曲中的酶类能将淀粉、蛋白质等分解成多风味的小分子化合物，该产品色、香、味、体均比普通酱油好。

在豆酱生产中，将红曲与黄曲以比例加入到熟料中一起发酵制成的红曲豆酱，色泽赤红、味道柔和爽口、风味独特、香味浓郁。红曲加入人们喜欢的低盐豆酱中具有防腐作用。在日本，红曲豆腐作为健康食品备受青睐。

豆腐乳生产中，在豆腐坯制成腌坯装坛后，将红曲、面酱、料酒按一定比例制成红曲卤作豆腐乳的卤汁，在常温下发酵制成红方腐乳，色泽红艳、口感细腻、香味浓厚。红曲的添加量还可根据不同消费者的要求而调整制成色泽深浅不同的系列产品，如红曲酱腐乳，既有红方腐乳的风味米，又具有酱腐乳特有的酱香味。